Når eleverne starter på mellemtrinnet, har de mange af de samme fag som i 3. klasse, men som noget nyt får eleverne fagene tysk eller fransk, håndværk og design og madkundskab.
I 5. klasse bliver eleverne introduceret til et andet fremmedsprog. På Fårup Skole og Børneby har eleverne tysk.
I 6. klasse får eleverne ikke nye fag, men der bliver bygget videre på fagene fra 5. klasse.
I løbet af 5. eller 6. klasse skal eleverne desuden deltage i cyklistprøven. Læs mere om cyklistprøven på Sikkertrafik.dk.
På mellemtrinnet har de ansvaret for skolens bod. De står også for både skuespil og mange af forberedelserne til den årlige skolefest.